@青岛人 重大突破 你们爱吃的对虾 基因组被破译

对于爱吃海鲜的青岛人来说，

对虾是餐桌上常见的一种美食。

不过你可能不知道，

由于种质资源匮乏，

我国的对虾养殖，

每年需从国外引进大量亲虾，

我国自主的对虾分子遗传育种工作

迫在眉睫！！！

而在最近，

中科院海洋研究所，

成功破译了凡纳滨对虾基因组，

获得了国际首个

高质量对虾基因组参考图谱。

可能很多跟小编一样、

不懂这些专业知识的人，

看了这些图也都是一脸问号

所以今天让专业研究员，

用简单的语言来告诉你，

破译以后有什么重大意义！

科普时间到：

作为四大养殖虾类之首，凡纳滨对虾全球年产量达416万吨，而我国凡纳滨对虾养殖产量超过世界的1／4。

由于基因组信息缺乏，目前凡纳滨对虾以传统育种为主，每年我国需从南美引进种虾20到30万对，占到全国种虾的8成以上，而以每对100美元计算，价值超过2000万美元。

基因组的破译成功，将极大推动分子育种和全基因组育种，更容易获取所需要的优良品种，改变对虾养殖现状。

△李富花 中科院海洋研究所研究员

不仅如此，基因组破译以后，通过对基因功能的研究，未来将可实现针对性的基因编辑，最终实现定向育种。同时在生物学角度，基因组破译还解释了对虾神经传导速度快、蜕皮次数多等特殊生命现象。

△张晓军 中科院海洋研究所研究员

所以研究员们，

到底是怎么破译的呢？

他们都面临了哪些难题？

让他们亲口告诉咱！

凡纳滨对虾基因组被成功破译

基因组由4种不同的碱基构成，而此次破译的凡纳滨对虾，也就是俗称的南美白对虾，基因组约有24亿个碱基对组成，相当于一串由24亿个字母构成的密码。

而此次成功破译的基因组共有16亿个碱基对，4600多段长序列，平均长度60万个碱基对，平均长度在对虾和甲壳动物物种中为组装最好。

△张晓军 中科院海洋研究所研究员

简单重复序列比例高 破译难度大

凡纳滨对虾是世界上最早开展基因组测定的水产养殖生物之一，从1996年便开始进行破译，然而由于其基因组的高复杂性，多个国际科研机构一直未能成功破译。

根据分析发现，对虾的简单重复序列占基因组的近24％，是目前已测基因组物种中含量最高的，而这也成为凡纳滨对虾破译的最大难点。

△李富花 中科院海洋研究所研究员

十年磨一剑 突破关键及时实现破译

中科院海洋所从十年前开始进行凡纳滨对虾基因组破译，随着2014年第三代测序技术的普遍应用，极大地解决了简单重复序列的问题。

经过努力，科研人员最终测得了上千万段读长，也就是基因片段。而如果将每一段读长比喻为拼图的一块，基因组的组装工作则相当于拼起一张上千万块的拼图，为此中科院海洋所的研究人员与国内外多家单位共同合作，历经数年，突破一些列技术难关，成功破译凡纳滨对虾基因组。

△李富花中科院海洋研究所研究员